Pego la respuesta de un colega al mismo problema, a ver si os sirve:
He arreglado el joycon, resulta que llevan una goma por debajo para q no entre polvo, en el momento q se te mete una mota hace q se mueva solo el personaje, la he desmontado y limpiado con alcohol, y ha vuelto a la vida, he mirado por YouTube como desmontarlo y me salían dos vídeos con el mismo problema y como arreglarlo