Particularmente me encantan las grandes joyas de sobra conocidas por todo el mundo como la Saga Donkey Kong Country, Super Mario World o Yoshi’s Island.
Otros imprescindibles son CastlevaniaIV y Las Tortugas Ninja. También incluiría todas las joyas Disney desde MickeyMania hasta LionKing, pasando por Aladdin (ambas versiones, SNES y MegaDrive).
Pero como pedías menos conocidos, en mi caso recomendaría la saga StarWars (obras de arte, en especial El Retorno del Jedi), Indiana Jones, Batman Returns (el mejor Bet’m up junto con Las Totugas) o SkyBlazer.
Dentro del genero de la lucha, DragonBallZ sobre todo el segundo, Ranma1/2 y Killer Instinct, además de los obvios Street Fighter, por supuesto.
Otros plataformas menos conocidos que me vienen ahora a la mente, y que también están muy bien son Busbsy The Bobcat, Cool Spot y sobre todo Earth Worm Jim.
Pasando al genero mas deportivo en su rama arcade, imprescindibles FZero y SuperTennis, superadictivos aunque se nota merma gráfica por ser de la primera hornada.
Y ya por último te recomiendo el Rock’n Roll Racing.