Re:(Ayuda) con disco duro y como apagar la Wii U

No apagues las dos cosas. Apaga el gamepad manteniendo presionado el botón, y si la consola no apaga instantáneamente espera un tiempo prudencial. Se me hace que lo que pasa es que no apaga porque está intentando desconectar el disco de forma segura antes de apagarse.
También probaría conectar el disco en otro usb de la consola.