Aviso: Este comentario contiene revelaciones.
En mi opinión, lo mejor es ir alternando, ambas cosas son muy útiles. Eso sí, si buscas dificultad, escoge sólo resistencia, y si quieres conseguir rápidamente la espada maestra, escoge sólo corazones. De todos modos, si cambias de idea, existe un modo de cambiar corazones por resistencia o resistencia por corazones (Eso sí, gasta unas pocas rupias), así que tampoco te preocupes mucho.