Respuesta a: Duda sobre Nintendo ID

En principio si y no deberia darte ningun problema, eso si antes debes desvincular la 3ds para que puedas vincular la New (creo que funciona asi para no duplicar los juegos descargados en diferente consolas) y para esto debes formatearla. Poder, se puede seguro porque para eso se asocian las compras a un ID y no a la consola en cuestion.
Ten esto en cuenta si vas a pasar datos de tu 3ds a tu New3ds (para no perderlo todo ya que hay que devincularla…) https://www.nintendo.es/Atencion-al-cliente/New-Nintendo-3DS-y-New-Nintendo-3DS-XL/Transferencia-de-datos-entre-consolas/Guia-paso-a-paso-de-transferencia-entre-consolas/Guia-paso-a-paso-de-transferencia-entre-consolas-956502.html
Es decir n puedes tener las 2 3ds vinculadas con sus compras, pero si pasar de una a otra
Espero te sirva de ayuda ^^